(3)病毒性呼吸道疾病 ( 流行性感冒、猪只繁殖及呼吸道征候群 PRRS、假性狂犬病 PR、猪呼吸性冠状病毒等。台湾地区应该加上猪瘟 )：前三种疾病有现成疫苗可使用。不过，除非一贯场每批成长肥育猪皆会感染同时又会出现二次性细菌问题，否则本人不认为使用流行性感冒疫苗会具有成本效益。PRRS 疫苗则被证实，若用於预防保育猪并发更严重的细菌疾病时具成本效益。该疫苗应使用於母猪群以安定母猪群的免疫力并避免母猪传染小猪。但如果等爆发 PRRS 较长时间後才使用，则成本效益可能较差。
PR 疫苗如果使用於成长猪来预防肥育猪群的二次性呼吸道疾病，则具成本效益。
根据前面的讨论，藉着抗生素及疫苗来治疗及控制一贯场的成长猪，证明养猪户如果使用新技术，局部的解决方式并无法降低生产成本，但在某些场合，如果策略应用得宜，的确也具成本效益。但话说如此，即使是最成功的实例，可能也无法达到每公斤体重降低美金 0.05 元 ( 新台币 1.65 元 ) 以上的目标。
一贯场完全克服呼吸道疾病问题的方法：
SPF ( 无特定性病原 ) 系统：多年来发展与培育出最少疾病猪只的技术，早已是养猪界重要的课题。於 1950 年代就发展出 SPF 计划来降低猪群间与猪场间疾病之散布并且能使畜主於卖猪时获得额外奖金。由於开始的花费高而且投资报酬率也不稳定，以及万一遭受感染时所需再繁殖的成本高，所以大部份畜主执行计划的速度甚缓而且意愿不高，一直到最近的用药早期离乳 ( MEM )、隔离离乳 ( Isowean ) 及统进统出 ( all-in, all-out ) 等诸多研究成果出现并成熟後，畜主才再度重拾信心。无论如何，将一贯场饲养的猪群转换成 SPF 猪群或其他健康程度优良种猪群的方式，可以使目前既有的一贯猪场得以与那些使用新技术、无呼吸道疾病新品系之新式猪场互相竞争与抗衡。
统进统出管理系统
普渡大学的研究人员研究霉浆菌 ( M.hyopneumoniae ) 到底是由母猪传染给小猪、或是在保育舍内猪只相互传染，或是在一贯场内由老猪传给小猪。结果显示，如果由已感染母猪所产之小猪，於 28 日龄离乳并隔离饲养，不会出现临床症状或肺部病变。即使将保育舍内同胎之仔猪於 8 周龄时互相隔离，也不会发病。上述的二个案例，某些猪只的肺部与具有高抗体的猪只血清都可以分离到霉浆菌的存在，显示其传染是垂直性的，而且发展出不显性感染。随後另一个试验则研究统进统出饲养之猪只於田间饲养是否亦有效。三群已感染 SEP 之猪群依年龄分组，以统进统出方式由产房移至保育舍饲养，然後再移至以墙隔离的肥育舍，或是移至该场的另一畜舍内饲养。这些猪只的生长表现再和留在原一贯作业方式饲养的猪只加以比较。结果发现，所有以统进统出方式饲养的猪只出现肺炎的机会较低，同时上市日期亦提早 2 至 6 周之多。
研究人员随後进行研究以进一步了解需要多少隔离才能达成前面试验所获致之利益。一群感染 SEP 的猪群，於保育期先以统进统出方式饲养。於 8 周龄时，有些被移至另一畜牧场饲养，有些则被移至该场的另一隔离舍饲养，有些则被置於一贯场肥猪舍内以墙隔开的另一角饲养，另一些猪则继续养在原一贯场的肥猪舍内，并且与正在咳嗽的猪只仳邻。结果显示这些猪只的隔离程度如果愈好，屠宰出现的肺部病变愈低。隔离程度愈好生长率亦愈佳，但是在肥猪舍内以墙隔开另一角饲养的组别却是例外。因此，如果要预防呼吸道疾病并改善生长效率，离场隔离方式比原场内不同猪舍隔离的效果好，又比於同一栋猪内隔离处理的效果更佳。於一贯场内饲养的猪只，感染肺炎的机会最大而且其生长最缓慢。
上述用於一贯场的方法，可用於局部改善一贯场内的呼吸道疾病问题。本人及其他研究者皆发现，一旦使用统进统出饲养方式，每只 240 磅体重猪只的生产成本可降低达美金 3.00 元，也就是大於或等於每公斤体重美金 0.03 元 ( 新台币 0.99 元 )。
