3、通过转基因技术获得。代表性品种有：
低过敏米。日本将其列为第一功能食品，食用后能防过敏。采用基因重组技术培育而成，变应原蛋白质可减少80%。也可利用蛋白酶反应，将导致人体（特别是小孩）过敏性皮炎、皮疹等发生的过敏原蛋白除去。据临床试验，1000名米过敏患者，有90%得以改善。
低蛋白米。日本通过置换遗传基因开发出低蛋白米，其主要蛋白，即各蛋白含量比通常大米减少40%。通过将阻碍形成各蛋白DNA遗传基因移入稻米细胞，使大米低蛋白化，尤其适合酿酒用及忌食蛋白的人群食用。
高半胱氨酸米。日本将产生半胱氨酸的基因大量植入水稻细胞，培育而成富含半胱氨酸蛋白质，可抑制病毒繁殖所需酶之活性。将这种米提取液注入感染脊髓灰质炎病毒细胞，病毒便能停止增殖，也可防止引起食道感染的病毒增殖。
高含铁米。日本科学家用转基因技术培育成的高含铁米，是将大豆中的铁蛋白基因取出，然后植入土壤杆菌，并利用这种转基因杆菌感染水稻植株，使水稻也具有这种高铁量基因。据分析，这种转基因水稻大米10粒含铁3.4μg，比通常大米高出2倍左右，只要三餐食用这种米就能满足人体每天需铁量的30%—50%。
防动脉硬化米。日本利用转基因技术，借助于土壤杆菌把大豆球蛋白基因植入水稻中培育而成的大米，能提高大米中大豆球蛋白及赖氨酸含量，大豆球蛋白能降低血中胆固醇含量，防止动脉硬化。
富含维生素A米。国际水稻研究所应用现代生物技术克隆合成维生素A或维生素A前体基因移入水稻植株，培育出的大米富含维生素A，可望成为低成本药品的载体，从而给因严重缺乏维生素A而患眼病的人们带来福音。瑞士科学家通过在稻谷植株中加入三种基因，最终培育出富含β－胡萝卜素转基因稻谷，食用这种米后，米中β－胡萝卜素可在人体内转换成维生素A。
4、其它途径获得。代表性品种有：
低磷化米。日本采用乳酸菌使米中含磷量降低，能减少3／4的磷。低磷化大米在一定程度上可预防因缺钙引起的骨质疏松症，对肾功能不全者、中高龄人都有效果。
功能肽米。日本应用酶切技术，从大米中提取可促进胰岛素分泌的5个氨基酸组成的降血压肽、增强免疫系统肽，可作为添加剂添加到大米中制取保健功能各异的功能肽米，成为具有划时代意义的功能性食品。
人参米。韩国开发成功的人参米是将当地产大米和人参液混合烘干而成，可长期保存，并且可以干吃。煮饭时只要在米中加入20克人参米，便做成可口的人参米饭。
叶绿素米。美国用一定比例的叶绿素水溶液喷雾到大米表层或浸泡，再经干燥制成的叶绿素米呈绿色，在宴席上可增添情趣和食欲。
苹果米。美国利用苹果胶和大米粉制成苹果米，产品为微黄色，具有苹果味和高度吸湿性。苹果米可制作成馅芯，作为馅饼和富含维生素面包的馅料。
强化米。美国生产的强化米是将大米吸足含维生素B1、B2、烟酸、铁的溶液，再在米粒表面涂上含玉米朊等不溶性蛋白的酒精溶液薄膜，冷水淘米时米中的维生素不会流失，蒸煮米时薄膜融化，营养素能均匀扩散到米饭中。
2014年3月份，央视曝光了一些高价高铁米、高锌米等功能性大米，里面所含的营养成分根本与普通大米无区别，纯属虚假宣传。
在同一家超市，普通散装大米每斤售价在1.50元至2.00元之间，袋装精品米价差悬殊，便宜的每斤两三元钱，而宣称高锌、富硒等功能性大米，售价普遍要比普通大米贵，有些售价要贵一倍以上。比如5公斤装的某品牌富硒大米，售价要68元。
作为食品和保健品的功能性大米，在促进人体健康方面起到了普通大米所不具备的特殊作用。可是，在现实生活中，一些厂家、商家正是抓住了人们对健康食品的需求，鱼目混珠，以假乱真，扰乱了人们的视线。
目前市场上功能性大米存在的问题固然不少，但主要是缺乏国家标准。目前涉及功能性大米只有GB/T22499-2008《富硒稻谷》的国家标准，规定富硒稻谷是生长过程中自然富积而非收获后添加硒、加工成符合GB1354《大米》标准规定的三级大米中硒含量在0.04mg/kg至0.30mg/kg之间的稻谷。
规范功能性大米市场，要从以下4个方面努力。
加强宣传引导。功能性大米是在含有对人体有益微量元素土壤中自然生长的稻米加工而成的大米，或者运用现代高科技手段添加人体必需的微量元素而生产的大米。功能性大米是食品、保健品，不是药品。它是通过不同人体对微量元素的需要而食用的大米，广大消费者要根据自己的身体特点合理食用，不可替代药品。不要相信虚假宣传，以咋传咋。
完善国家标准。随着人民生活水平的提高和对营养、健康的渴求，功能性大米的食用量将呈增加的趋势，功能性大米的市场将逐步越来越大。站在对消费者利益和健康保护的高度，国家有关部门要启动包括功能性大米在内的功能性食品国家标准的修订、完善工作。我们说功能性大米好，并不是只要标注“功能性”大米的米都好。要注意三个方面的问题。一是微量元素达不到国家标准，就不能达到保健的作用；二是微量元素含量要适度，并不是越多越好。比如硒，人缺了会生病，多了又会中毒，会出现面色发黄，头发掉光等现象。象克山病、大骨节病等都是摄入硒含量过高的结果；三是有些微量元素对人体是有害的。如铅、汞等会造成疾病。制定、完善功能性食品国家标准，有法可依，有法必依至关重要。
加大科研开发。包括功能性大米在内的功能性食品，有些是在天然含有对人体有益的土壤中生长出来的，有些则是在大米产后添加进去的。看似很简单的微量元素添加技术，实则需要很高的科技含量。有关科研机构、高等院校等，要加大研发力度；粮食、食品加工企业要与科研机构、高等院校密切联合，舍得人力、物力、财力的投入，不断开发出有益于人身健康的功能性食品。
打击违法行为。功能性大米生产的特殊要求，以及食疗、保健功效，决定了市场价格自然比普通食品要高。
2014年6月19日在北京举行的、为期三天的“2014年中国国际食品安全与创新技术展览会”上，人们发现在韩国展区一家“功能性和营养大米”受到很多专业观众的青睐。
这些大米产品是韩国食品药品安全厅认证的功能性食品配料，是由认证的有机大米制成的营养性有机大米。在原料选择上选取100%的新大米，通过添加番茄、姜黄、西兰花等植物营养素的色彩，以增加人们的食欲。这些大米富含胶原蛋白、钙、番茄红素、姜黄素、胡萝卜素、叶绿素等。这些大米烹制简单，适合婴儿、少年、患者人群，目前在韩国很多学校都是选择采购这种大米。
韩国的这种大米比普通大米在价格上要高出几倍，经过这些工艺技术使普通大米增加了附加值。
追求利润最大化的不法厂家和商家，会千方百计想从功能性食品中分一杯羹。无中生有、以次充好、以假乱真等，是他们惯用的伎俩。各级农业、工商、粮食、食品监管等部门要严格要加强食品生产、加工、销售等环节的监管，严厉打击各种违法行为，保持功能性食品市场的规范、有序，为人民身体健康把好牢固的防线。
