一、农业结构的调整与农业发展的要求仍有较大的差距。重点产业的规模化、产业化水平低，特色产品缺乏竞争力，有“优势”而无“规模”，有“名气”而无“品牌”。
二、农业产业化发展缺乏总体规划。各乡镇的主导产业没有独立性，都是粮油、蔬菜、瓜果、畜禽等大众化农产品，尚未真正形成“一乡一业、一村一品”产业框架。
三、动物疫病防控能力偏弱。一是动物防疫人员素质不高，特别是村级防疫员待遇低，思想不稳、流动性大，在一定程度上影响了防控工作开展：二是防控经费不足，防疫措施难以落实。三是防疫意识淡薄。部分畜禽养殖者对法律意识淡薄，自觉防疫意识差，病死畜禽不能依法正确处理，传染源得不到有效控制。四是养殖水平低。部分养殖场（区、户）饲养管理水平低，饲养密度大、管理粗放，存在防疫制度不健全、防疫设施落后、畜禽粪便乱堆乱放等疫情隐患。
四、规模化养殖水平仍需提高。一是规模养殖起点比较低。在规模养殖中，小规模养殖场（户）占有较高比例，获得生产、销售、技术和信息的能力差、渠道少，生产水平低，参与市场竞争能力弱，容易导致区域性、阶段性的盲目发展，进而导致供需失衡、价格波动，生产大起大落。二是标准化生产水平较低，存在建设无规划、生产无标准、操作无规程、管理无规范、制约无法规的现象，产品卫生质量难以保证。有些养殖小区并没有真正摆脱传统生产管理方式，实质是以户为单位的区域化散养。
五、龙头企业和农民专业合作社的经营运行机制与农产品市场需求和农业产业化经营发展的要求不相适应，带动作用发挥不充分，缺乏相互协作、共同发展的理念，企业与农民连接不紧密，造成自身经济实力不强、带动辐射力不强。
六、农业生产信息和科技服务滞后。大多数农民科技文化素质不高，缺乏高质有效的信息捕获渠道和手段，使得农产品供需信息、价格信息难以及时传送到农民手中。加之，农民生产经营带有一定的盲目性，无法有效抵御市场风险，农民增产不增收的问题仍然突出。
七、农技推广服务体系建设没有到位，农业科技人员短缺，农业科技成果、实用技术推广速度缓慢，生产管理水平低下。
