五原县畜牧业发展具有悠久的历史，为传统畜牧业大县，1983年，河套大耳猪被内蒙古自治区牲畜种子管理资源委员会命名瘦肉型地方猪种，2007年通过国家遗传资源命名具有自主知识产权的巴美肉羊，巴美肉羊的培育五原县作为重点参与旗县，五原县在生猪和肉羊品种培育上作出了突出贡献。
2015年，共完成绵羊改良配种81.3万只、山羊改良配种4.53万只，生猪改良配种30.3万口，其中人工授精1.6万口，奶牛改良配种0.57万头，截止目前，引入杂交母羊2340只，种公羊1347只，优质种猪2780头，调剂串换种公羊13627只。推广良种家禽110万只，引进种驴859头。
五原县通过调运良种，开展同期发情、人工授精，胚胎移植等繁殖技术的示范推广，品种改良步伐明显加快，使种畜个体肉、乳产量大幅增加，肉羊胴体重较2003年增加10—15千克，每头奶牛年产奶量较2003年增加1.5吨，发挥了优质种畜对畜牧业的贡献，畜牧养殖业实现优质高效发展。
