昌吉市着力打造“三大畜牧”。
生态畜牧。按照品种优良化、养殖设施化、生产规模化、防疫程序化、管理科学化、粪污无害化要求，建成规划布局合理、功能设施齐全、养殖方式先进的标准化养殖场，同时，以畜禽养殖为中心，因地制宜配置有机肥生产、饲草料种植、蔬菜种植等产业，形成高效、无污染的配套系统工程，建立循环发展体系，破解规模化养殖污染难题。截至目前，打造生态畜牧业示范点2个、国家级标准化示范场4个、自治区级6个、自治州级15个。
无疫畜牧。严格实施规模养殖场程序化免疫和散养畜禽春秋两季集中免疫，确保免疫密度和质量。做好监测预警，加强流行病学调查和预警预报，构建有效的动物免疫屏障。截至目前，无重大动物疫情发生。
食安畜牧。加强动物卫生检疫监督，对免疫、用药、疫病诊疗等进行全面监管，确保规模养殖场产地检疫率达100%；抓好定点屠宰，同步开展布病检测，确保上市肉品质量安全；加强兽药、饲料、添加剂等投入品管理，规范经营秩序，从源头上保障畜产品安全。截至目前，完成畜产品检测1260批次。
